Мне удалось довольно хорошо почистить html и все еще держать проблему. Я заменил весь javascript на эквивалентные пробелы и символы новой строки и смог удалить большинство атрибутов элементов, не затрагивая ghost-ячейку.
Похоже, что в IE возникла проблема с буфером, поскольку удаление одиночных пробелов или новых строк в «безопасной области» приводит к исчезновению призрачной ячейки, а удаление целых атрибутов не влияет на рендеринг.
Я вижу, что у вас есть незакрытые теги, но мне также удалось полностью удалить их (заменив пробелами), не удаляя ячейку-призрак.
В результате я получил HTML без JavaScript с ghost-cell. Смотрите результат здесь: http://compscicon.no/ghostcell.htm