Я использую TortoiseSVN в среде Windows. Я получил эту же ошибку при попытке зафиксировать файлы проекта, предположительно написанные в Linux (проект AVR32). Я смог обойти эту проблему, просто открыв каждый файл в Microsoft Visual Studio, и в этот момент VS предложил мне нормализовать окончания строк. Решение сделать так заставило черепаху перестать жаловаться.