Вот ссылка, которая показывает проблему: http://xotics.equivalenceclass.com/test.php
В IE7 он открывается за голубым DIV "home-banner" и "home-banner-wrapper". Я не уверен почему. При удалении фонового изображения для «home-banner», но я не верю, что это решает проблему. Я попытался поиграть со свойствами CSS элементов z-index безрезультатно.
Это потому, что у вас есть position: relative на содержащем div. Z-индексы будут применяться только внутри этого div. Добавьте z-index в #header, и он должен работать.
position: relative