Вы, похоже, ищете функциональность матричного подмножества Matlab.
В основном, для
M = [ 1 2 3 4 5 6;
4 5 6 7 8 9;
7 8 9 0 1 2;
0 1 2 3 4 5;
3 4 5 6 7 8;
6 7 8 9 0 1];
Если у вас максимум на (3,3), вы можете использовать M(2: 4, 2: 4), чтобы получить
N = [ 5 6 7;
8 9 0;
1 2 3];
Суммирование, что матрица - это все, что осталось - так просто, как
total = sum(N(:));