Используя комбинацию dir и grep, это не так уж плохо. Возможно, это можно превратить в функцию, которая также сообщает вам, какие файлы должны быть удалены, и дает вам возможность прервать, если это не то, что вы ожидали.
# Which directory?
mydir <- "C:/Test"
# What phrase do you want contained in
# the files to be deleted?
deletephrase <- "deleteme"
# Look at directory
dir(mydir)
# Figure out which files should be deleted
id <- grep(deletephrase, dir(mydir))
# Get the full path of the files to be deleted
todelete <- dir(mydir, full.names = TRUE)[id]
# BALEETED
unlink(todelete)