Вам нужна мощная инфраструктура для КИ, если вы планируете сделать ее надежной.Посмотрите, очищены ли и правильно ли настроены артефакты сборки в teamcity.Вместо того, чтобы выполнять очистку в одном параметре, вы можете автоматизировать ее и, возможно, периодически удалять относительно старую историю сборки
И ответ на ваш вопрос - Нет, очистка не требует выключения сервера, пока он не выйдет из строя.
Редактировать: Отключение команды может быть вызвано множеством причин, о которых я могу только строить догадки.Возможно, его закрыли из-за аварии.Но в соответствии с политикой, приведенной в вики Jebrains, нет никаких упоминаний об отключении сервера.И совершенно не логично отключить весь сервер для очистки. Источник.