В связи с тем, что агенты выполняются, нет возможности напрямую вызывать методы для агента. Межпроцессное взаимодействие напрямую не поддерживается.
Единственная альтернатива IsolatedStorage для связи на устройстве - это использование базы данных (SQL CE).
Вы могли бы связать оба процесса через внешний веб-сайт, но это, вероятно, излишне и может вызвать проблемы, если нет доступного сетевого подключения.