Сохраните значение (в идеале в Memcache, но MySQL тоже работает отлично), которое говорит, сколько людей загружают.Он начинается с нуля, затем, когда кто-то начинает загрузку, вы увеличиваете его, прежде чем начинать обрабатывать загрузку.Когда загрузка завершится, уменьшите счетчик еще раз.
Если счетчик превышает ваш порог, запретите пользователям доступ к загрузчику или выдайте дружеское сообщение об ошибке.
Либо найдите хост случшие системы.Я надеюсь, что это не считается рекламой, но хост, которым я пользуюсь , предоставляет гораздо, НАМНОГО лучше системы и почти наверняка дешевле, чем то, что вы платите своему нынешнему хосту.