То, что вам нужно, это использовать опцию столкновения виджета положения (установите его в none).Значением по умолчанию является переворот, который пытается автоматически настроить положение (для видимой части страницы)
http://jqueryui.com/demos/position/#option-collision
$(document).ready(function () {
$(".positionLogo").position({
of:$("#idIframe"),
my:"left bottom",
at:"left bottom",
collision: 'none'
});
});