Одной из важных вещей при выборе новой технологии является доступность поддержки этой технологии. Если это величайшая, самая элегантная технология в мире, но есть только один парень, который знает, как ее использовать, то вам, вероятно, не стоит использовать эту технологию.
При этом существует более 7000 узлов node.js, помеченных на stackoverflow, и только 48 вопросов, помеченных ape. Теперь, возможно, разработчики APE где-то имеют свое собственное сообщество, но это все еще указывает на то, что это недостаточно большой пул пользователей, чтобы надежно получать помощь, когда она вам нужна. Уже одно это заставило бы меня сильно к Node.JS и Socket.IO.
Вот еще один вопрос о том же: Ajax Push Engine (APE) против Node.js