Иногда вещи кэшируются Eclipse, и это демонстрирует странное поведение. Я попытался бы отключить затмение и снова запустить его с опцией -clean. Это должно решить проблему.
Если нет, выключите компьютер и оставьте его прибл. 45 секунд и очистить всю память. Затем перезапустите и снова запустите Eclipse.