тепловые карты с огромными данными - PullRequest
1 голос
/ 17 января 2012

Я пытаюсь кластеризовать данные и затем построить тепловую карту, используя heatmap.2 из gplots , скрипт отлично работает с матрицами до 30000 строк, проблема в том, что я использую матрицы до 500000 строк (data_sel), и при попытке кластеризации я получаю эту ошибку:

heatmap.2(as.matrix(data_sel),col=greenred(10), trace="none",cexRow=0.3, cexCol=0.3,  ColSideColors=fenot.colour, margins=c(20,1), labCol="", labRow="",distfun=function(x) dist(x,method="manhattan"))
Error in vector("double", length) : vector size specified is too large

Есть ли какое-либо приближение, использующее R для построения тепловых карт с его большими данными?

Заранее спасибо

...