Если вы хотите скрыть настройки своего приложения, большинство пользователей недостаточно опытны, чтобы искать в реестре ключи, относящиеся к приложению.Кроме того, как указывалось в других ответах, в те времена, когда еще не было стандартов файла конфигурации XML, реестр был рекомендуемым местом.
В настоящее время рекомендуемым вариантом является файл конфигурации XML;он не будет добавлять данные в файл, который загружается при запуске, а это означает, что вы не вносите значительный вклад в проблему компьютера, на котором много загруженного реестра.Его легче изменить (при условии, что у вашего пользователя есть права администратора, и в любом случае вашей программе потребуется специальное разрешение для доступа к файлу для внесения программных изменений).
Если вы хотите сохранить данные вдали отслучайный пользователь, база данных SQLite - это относительно легкий способ хранения небольших объемов данных, таких как пользовательские настройки, способом, который нелегко изменить без доступа к SQLite.Просто помните, что если вы можете войти, то можете и другие, как бы трудно это ни было.