Конечно; вы обычно определяете сервисный контракт (интерфейс), который эти две службы будут использовать для обмена сообщениями; тогда одна из служб Windows будет размещать службу WCF (в этом случае, когда две службы находятся на одном компьютере, вы обычно используете привязку только локально, например, именованные каналы). Тогда вторая служба win может выступать в качестве клиента для службы WCF в других службах Windows. Есть ли какая-то конкретная проблема, с которой вы столкнулись?