Я использовал Eclipse Kepler.
Ограничить поиск только исходными файлами, то есть только .java файлами, введя " .java " в поле File name patterns(Separated by commas):
на вкладке Поиск файлов на вкладке Диалог поиска.
Добавление дополнительных шаблонов имен файлов, разделенных запятыми, например: *.java, *.xml, *.properties, *.txt
и т. Д.