У меня тоже самое. Я предполагаю, что вы работаете с Cassini (встроенным веб-сервером).
Мне еще предстоит найти ответ на этот вопрос (я просто возвращаюсь к VS и нажимаю Shift + F5 , чтобы остановить отладчик), но я могу сказать вам, что если вы проверите В поле «Редактировать и продолжить» в свойствах проекта (вкладка «Интернет») веб-сервер будет останавливаться и перезапускаться при каждом запуске приложения.
Это не решает всей проблемы, но мне достаточно.