В cocos2d нет окон или разделений сцен.
Вы не делите сцену, вы делаете ее похожей на разделенный экран, размещая и изменяя размеры элементов соответствующим образом.
На простейшем уровне вы можете иметь спрайт с 384 точками вверхняя часть экрана и некоторые кнопки в нижних 96 точках, которые влияют на спрайт или другие элементы в верхних 80% экрана.
Может оказаться полезным поместить два «деления» в разные слои.