Несколько советов, которые могут быть полезны:
(1) Если в вашей группе несколько серверов BizTalk, обязательно обновите все серверы!
В зависимости от конфигурации вашего экземпляра хоста, ваш экземпляр может работать на любом сервере, на котором активен экземпляр хоста.
(2) Убедитесь, что вы перезапустили правильный экземпляр хоста biztalk. Это часто упускается из виду. Не забывайте об изолированном хосте BizTalk! При необходимости выполните перезапуск определенного пула приложений IIS. Если вы не уверены, выполните iisreset.exe
(3) Чтобы обновить DLL в BizTalk, часто необходимо обновить ее и в базе данных BizTalk. Для некоторых изменений может сработать только обновление DLL в GAC, но часто я нахожу, что этого недостаточно (особенно с оркестровками).