Да, при условии, что у учетной записи есть соответствующие разрешения, которые вы можете использовать:
SELECT <...>
FROM A.table1 t1 JOIN B.table2 t2 ON t2.column2 = t1.column1;
Вам просто нужно добавить префикс ссылки на таблицу к имени базы данных, в которой она находится.