Это невозможно, так как PopupManager является дочерним элементом SystemManager и обрабатывает множество других слоев поверх уровня приложения. Этот первый параметр указывает только на то, как он должен центрировать всплывающее окно при запросе через centerPopup (target).
Вам потребуется разделить приложение на сегментированные слои и создать собственный PopupManager, ориентированный на один из промежуточных слоев между ними.