Как у вас работает скрипт?Если вы можете запустить ее как команду gdb, то, вероятно, emacs сможет использовать ее вывод.
Я давно не использовал gdb из emacs, но, похоже, M-x gdb
просит выполнить внешнюю команду.Можете ли вы дать имя вашему сценарию там?
Если вы вообще не знаете gdb-mode
, возможно, стоит сначала попробовать его на небольшом проекте.