в IE, позиционированные элементы начинают новый порядок наложения, вызывая то, что вы видите. Иногда вы можете дать родительскому элементу более высокий z-индекс, и это решит проблему. Google для IE z-index ошибка, и вы найдете достаточное количество текста по теме.