Трудно ответить на этот вопрос, так как недостаточно информации, чтобы пройти мимо.Существует множество способов извлечь строку, которая не гарантированно является общей.
Строка поступает в формате фиксированной ширины?Вероятно, нет.
Что такого уникального в искомой подстроке, которую можно использовать для ее извлечения?
Рассматривали ли вы использование регулярных выражений?
perldoc perlrequick
и perldoc perlretut
должны предоставить необходимые знания для достижения поставленной цели.