Либо вставьте смарт-коды в ваш скрипт, либо просто запускайте скрипт каждые 30 минут
(например, сохранить файл, сообщив, на каком сервере он работал в последний раз)
OR
Запустить на web1, когда минута 00, запустить на web2, если минута 30.
# мин ч. Дом Мой Доу
0 * * * * web1
30 * * * * web2