Время от времени я сам сталкиваюсь с этой проблемой, даже в текущей версии Flash Builder 4.5 (хотя никогда не пытался ее воспроизвести).
Чтобы решить ее, сделайте следующее:
Щелкните правой кнопкой мыши свой проект на вкладке Project Explorer в Flash Builder> Свойства
После этого выберите Путь сборки ActioScript> Путь к библиотеке> Добавить папку SWC
Выберите этот каталог C: \ Program Files \ Adobe \ Adobe Flash CS5.5 \ Common \ Configuration \ ActionScript 3.0 \ FP9
(необязательно) Если вы хотите использовать целевой FP10, добавьте этот каталог вместо C: \ Program Files \ Adobe \ Adobe Flash CS5.5 \ Common \ Configuration \ ActionScript3,0 \ FP10