Существует множество способов обнулить все данные. Возможно, самое простое:
VoV = std::vector<std::vector<float> >(num, std::vector<float>(3, 0.));
Или,
std::fill(VoV.begin(), VoV.end(), std::vector<float>(3, 0.));
Или,
for(std::vector<float>& v : VoV)
std::fill(v.begin(), v.end(), 0.);
Или даже:
for(auto& v : Vov)
for(auto& f : v)
f = 0;
Примечание. Я не проверял ни одного из них.