Похоже, EdmModelDiffer является внутренним классом для EF Code Migrations, так что это довольно плохое сообщение об ошибке для передачи обратно пользователю.
В Entity Framework 4.3 EF Migrations используется для обнаружения изменений в модели и, при необходимости, для обновления базы данных. В этом сообщении блога объясняются некоторые подробности об edmmetadata и новых миграциях ef.
В качестве введения доступны некоторые пошаговые руководства по миграции EF (для Google). Об этом я написал серию .