Я только что столкнулся с этим с помощью IIS Express. Сейчас, чтобы обойти эту проблему, я переключился на использование сервера разработки Visual Studio (Cassini).
Вам также необходимо проверить версии jquery и jquery mobile, чтобы убедиться в их совместимости. Я работал с jquery-ui-1.8.11, который я скачал, но использовал jquery-1.5.1, который шел с шаблоном приложения ASP.NET MVC 3.
Когда я заменил jquery 1.5.1 на jquery 1.7.2, он начал работать.
Согласно:
http://jquerymobile.com/blog/2012/04/13/announcing-jquery-mobile-1-1-0/
Для jquery mobile 1.1.0 final требуется jQuery core 1.6.4 или 1.7.1