Чтобы иметь возможность запустить оболочку через MobaXterm в Windows:
Создайте новую оболочку из MobaXterm, нажав вкладку «+» 
Перейдите в каталог установки вашего докера:
cd "C:\Program Files\Docker\Docker\Resources\bin"
или с помощью:
cd /drives/c/Program Files/Docker/Docker/Resources/bin
Выполнить команду docker exec только с опцией
-i
nteractive:
./docker.exe exec -i your_docker_container /bin/bash
вы сейчас находитесь в среде bash вашего докер-контейнера, вы можете набрать ls
дляпример:

Если вам нужно подключиться к удаленному экземпляру докера, адаптируйте команду docker для включения удаленного хоста (-H
)
Протестировано с Windows 10, MobaXterm v10.9, docker v18.09.2.
Примечание: после некоторого тестирования в течение некоторого времени MobaXterm не обеспечивает хорошую поддержку интерактивной консоли докера (bashслужба поддержки).Лучше использовать оболочку cmd, powershell или аналогичную.