Это может решить проблему:
Добавить эту строку на server.js:
io.set('transports', ['websocket']);
Добавить это на client.js:
var socket = io('/',{transports: ['websocket'],upgrade:false});
И сделатьеще одна вещь, просто используйте более низкую версию socket.io как 2.0.3