Ранговые группы в сгруппированной последовательности TRUE / FALSE и NA - PullRequest
Новая
       17

Ранговые группы в сгруппированной последовательности TRUE / FALSE и NA

10 голосов
/ 10 апреля 2019

У меня есть маленький орех, чтобы взломать.

У меня есть data.frame, как это: 

   group criterium
1      A        NA
2      A      TRUE
3      A      TRUE
4      A      TRUE
5      A     FALSE
6      A     FALSE
7      A      TRUE
8      A      TRUE
9      A     FALSE
10     A      TRUE
11     A      TRUE
12     A      TRUE
13     B        NA
14     B     FALSE
15     B      TRUE
16     B      TRUE
17     B      TRUE
18     B     FALSE

structure(list(group = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 
1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L), .Label = c("A", 
"B"), class = "factor"), criterium = c(NA, TRUE, TRUE, TRUE, 
FALSE, FALSE, TRUE, TRUE, FALSE, TRUE, TRUE, TRUE, NA, FALSE, 
TRUE, TRUE, TRUE, FALSE)), class = "data.frame", row.names = c(NA, 
-18L))

И я хочу ранжировать группы TRUE в столбце criterium в порядке возрастания, игнорируя FALSE и NA. Цель состоит в том, чтобы внутри каждой группы был уникальный идентификатор группы group.

Таким образом, результат должен выглядеть следующим образом: 

    group criterium goal
1      A        NA   NA
2      A      TRUE    1
3      A      TRUE    1
4      A      TRUE    1
5      A     FALSE   NA
6      A     FALSE   NA
7      A      TRUE    2
8      A      TRUE    2
9      A     FALSE   NA
10     A      TRUE    3
11     A      TRUE    3
12     A      TRUE    3
13     B        NA   NA
14     B     FALSE   NA
15     B      TRUE    1
16     B      TRUE    1
17     B      TRUE    1
18     B     FALSE   NA

Я уверен, что есть относительно простой способ сделать это, я просто не могу придумать один. Я экспериментировал с dense_rank() и другими оконными функциями dplyr, но безрезультатно.

Ответы [ 4 ]

7 голосов
/ 10 апреля 2019

Другой data.table подход: 

library(data.table)
setDT(dt)
dt[, cr := rleid(criterium)][
    (criterium), goal := rleid(cr), by=.(group)]
6 голосов
/ 10 апреля 2019

Может быть, я слишком усложнил это, но один способ с dplyr это 

library(dplyr)

df %>%
  mutate(temp = replace(criterium, is.na(criterium), FALSE), 
         temp1 = cumsum(!temp)) %>%
   group_by(temp1) %>%
   mutate(goal =  +(row_number() == which.max(temp) & any(temp))) %>%
   group_by(group) %>%
   mutate(goal = ifelse(temp, cumsum(goal), NA)) %>%
   select(-temp, -temp1)

#  group criterium  goal
#   <fct> <lgl>     <int>
# 1 A     NA           NA
# 2 A     TRUE          1
# 3 A     TRUE          1
# 4 A     TRUE          1
# 5 A     FALSE        NA
# 6 A     FALSE        NA
# 7 A     TRUE          2
# 8 A     TRUE          2
# 9 A     FALSE        NA
#10 A     TRUE          3
#11 A     TRUE          3
#12 A     TRUE          3
#13 B     NA           NA
#14 B     FALSE        NA
#15 B     TRUE          1
#16 B     TRUE          1
#17 B     TRUE          1
#18 B     FALSE        NA

Сначала мы replace NA s в столбце criterium до FALSE и принимаем кумулятивную сумму заотрицание этого (temp1).Мы group_by temp1 и присваиваем 1 каждому первому TRUE значению в группе.Наконец, группируя по group, мы берем совокупную сумму для TRUE значений или возвращаем NA для FALSE и NA значений.

4 голосов
/ 10 апреля 2019

Чистое решение Base R, мы можем создать пользовательскую функцию через rle и использовать ее для каждой группы, т.е. 

f1 <- function(x) {
    x[is.na(x)] <- FALSE
    rle1 <- rle(x)
    y <- rle1$values
    rle1$values[!y] <- 0
    rle1$values[y] <- cumsum(rle1$values[y])
    return(inverse.rle(rle1))
}


do.call(rbind, 
     lapply(split(df, df$group), function(i){i$goal <- f1(i$criterium); 
                                             i$goal <- replace(i$goal, is.na(i$criterium)|!i$criterium, NA); 
    i}))

Конечно, если вы хотите, вы можете применить его через dplyr, т.е. 

library(dplyr)

df %>% 
 group_by(group) %>% 
 mutate(goal = f1(criterium), 
        goal = replace(goal, is.na(criterium)|!criterium, NA))

, что дает, 

# A tibble: 18 x 3
# Groups:   group [2]
   group criterium  goal
   <fct> <lgl>     <dbl>
 1 A     NA           NA
 2 A     TRUE          1
 3 A     TRUE          1
 4 A     TRUE          1
 5 A     FALSE        NA
 6 A     FALSE        NA
 7 A     TRUE          2
 8 A     TRUE          2
 9 A     FALSE        NA
10 A     TRUE          3
11 A     TRUE          3
12 A     TRUE          3
13 B     NA           NA
14 B     FALSE        NA
15 B     TRUE          1
16 B     TRUE          1
17 B     TRUE          1
18 B     FALSE        NA
4 голосов
/ 10 апреля 2019

A data.table опция с использованием rle 

library(data.table)
DT <- as.data.table(dat)
DT[, goal := {
  r <- rle(replace(criterium, is.na(criterium), FALSE))
  r$values <- with(r, cumsum(values) * values)          
  out <- inverse.rle(r)                                 
  replace(out, out == 0, NA)
}, by = group]
DT
#    group criterium goal
# 1:     A        NA   NA
# 2:     A      TRUE    1
# 3:     A      TRUE    1
# 4:     A      TRUE    1
# 5:     A     FALSE   NA
# 6:     A     FALSE   NA
# 7:     A      TRUE    2
# 8:     A      TRUE    2
# 9:     A     FALSE   NA
#10:     A      TRUE    3
#11:     A      TRUE    3
#12:     A      TRUE    3
#13:     B        NA   NA
#14:     B     FALSE   NA
#15:     B      TRUE    1
#16:     B      TRUE    1
#17:     B      TRUE    1
#18:     B     FALSE   NA

шаг за шагом

Когда мы вызываем r <- rle(replace(criterium, is.na(criterium), FALSE)), мы получаем объект класса rle 

r
#Run Length Encoding
#  lengths: int [1:9] 1 3 2 2 1 3 2 3 1
#  values : logi [1:9] FALSE TRUE FALSE TRUE FALSE TRUE ...

Мы манипулируем компонентой values следующим образом 

r$values <- with(r, cumsum(values) * values)
r
#Run Length Encoding
#  lengths: int [1:9] 1 3 2 2 1 3 2 3 1
#  values : int [1:9] 0 1 0 2 0 3 0 4 0

То есть мы заменили TRUE s на совокупную сумму values и установилиFALSE с 0.Теперь inverse.rle возвращает вектор, в котором values будет повторяться lenghts раз 

out <- inverse.rle(r)
out
# [1] 0 1 1 1 0 0 2 2 0 3 3 3 0 0 4 4 4 0

Это почти то, что хочет OP, но нам нужно заменить 0 s на NA

replace(out, out == 0, NA)

Это делается для каждого group.

данных 

dat <- structure(list(group = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 
1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L), .Label = c("A", 
"B"), class = "factor"), criterium = c(NA, TRUE, TRUE, TRUE, 
FALSE, FALSE, TRUE, TRUE, FALSE, TRUE, TRUE, TRUE, NA, FALSE, 
TRUE, TRUE, TRUE, FALSE)), class = "data.frame", row.names = c(NA, 
-18L))
...