Как сказал Киршштейн, вы можете заключить пары ввода / метки в элемент div и затем поместить их в div.
Или вы можете применить плавающие значения для входов и меток. Последнее предложение предполагает, что ваш код выглядит примерно так:
<label for="input1">Input 1</label>
<input type="checkbox id="input1" name="input1" />
<label for="input2">Input 1</label>
<input type="checkbox id="input2" name="input2" />