Удалось ли кому-нибудь из вас успешно создавать отчеты Clover для веб-приложений на Tomcat или любом другом веб-сервере?
Да. Вот документация Atlassian, которая помогла мне настроить его:
По сути, вы добавляете незначительную конфигурацию в настройку ant или maven перед компиляцией и перед запуском тестов, а затем запускаете покрытие как обычно.