В конце концов вам нужно будет развернуть новую версию приложения, где вам придется остановить текущее приложение и запустить новую версию. Это всегда можно сделать, убив старое приложение, но это увеличивает количество повторов, тайм-аутов или ошибок, все в зависимости от того, что делает ваше приложение.
Если вместо этого вы корректно остановите приложение, сначала опустошив поток, это уменьшит количество этих нарушений.