Как отсортировать по первому элементу каждой строки? - PullRequest
0 голосов
/ 02 июня 2019

Я пытаюсь отсортировать первый элемент каждой строки в алфавитном порядке, но изо всех сил пытаюсь заставить это работать.

[['^', 'G', 'A', 'T', 'T', 'A', 'C', 'A', '!']]
[['G', 'A', 'T', 'T', 'A', 'C', 'A', '!', '^']]
[['A', 'T', 'T', 'A', 'C', 'A', '!', '^', 'G']]
[['T', 'T', 'A', 'C', 'A', '!', '^', 'G', 'A']]
[['T', 'A', 'C', 'A', '!', '^', 'G', 'A', 'T']]
[['A', 'C', 'A', '!', '^', 'G', 'A', 'T', 'T']]
[['C', 'A', '!', '^', 'G', 'A', 'T', 'T', 'A']]
[['A', '!', '^', 'G', 'A', 'T', 'T', 'A', 'C']]
[['!', '^', 'G', 'A', 'T', 'T', 'A', 'C', 'A']]

Пробовал сортировать и сортировать функцию так же, как панды, но не могу заставить ее работать

with open ('BWT_test.txt','r') as seq1:
    sequence1 = seq1.read()
    seq1.read()
list1 = list(sequence1)
list1.insert(0,'^')
list1.append('!')
for seq1 in range(len(list1)):
    table1 = [list1[seq1:] + list1[:seq1]]
    sorted(table1)
    print(table1)

Код должен упорядочить список по этому адресу:

[['A', 'C', 'A', '!', '^', 'G', 'A', 'T', 'T']]
[['A', 'T', 'T', 'A', 'C', 'A', '!', '^', 'G']]
[['A', '!', '^', 'G', 'A', 'T', 'T', 'A', 'C']]
[['C', 'A', '!', '^', 'G', 'A', 'T', 'T', 'A']]
[['G', 'A', 'T', 'T', 'A', 'C', 'A', '!', '^']]
[['T', 'A', 'C', 'A', '!', '^', 'G', 'A', 'T']]
[['T', 'T', 'A', 'C', 'A', '!', '^', 'G', 'A']]
[['^', 'G', 'A', 'T', 'T', 'A', 'C', 'A', '!']]
[['!', '^', 'G', 'A', 'T', 'T', 'A', 'C', 'A']]

1 Ответ

3 голосов
/ 02 июня 2019
sorted(data, key=lambda x: x[0])

Или ...

from operator import itemgetter
sort = sorted(data, key=itemgetter(0))

Измените цикл следующим образом:

rotations = []
for seq1 in range(len(list1)):
    table1 = list1[seq1:] + list1[:seq1]
    rotations.append(table1)
rotations = sorted(rotations, key=lambda x: (x[0] not in string.ascii_letters, x[0]))
print([x[-1] for x in rotations])
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...