Когда вы запускаете команду из терминала, команда вступает во владение. Возможно, что после закрытия окна gedit процесс по какой-то причине продолжает выполняться.
Вы можете отправить команду в фоновом режиме при запуске, добавив & в конец:
gedit nameoffile &
Это должно немедленно вернуть вас к приглашению при запуске процесса.
В качестве альтернативы, вы можете приостановить процесс, нажав Ctrl-Z, а затем сделать с этим процессом множество вещей, таких как: убить его с помощью kill, отменить приостановку процесса и отправить его в фоновый режим с помощью bg, перевести его вернитесь на передний план с помощью fg, см. список запущенных заданий с jobs и более.
Подробнее о работе терминальных процессов можно прочитать здесь