Вам не нужно ничего делать.
Миграции - это кодовые файлы , поэтому их необходимо скомпилировать. Согласно документации здесь , все файлы кода включены в компиляцию по умолчанию.
И, конечно, если вы попытаетесь добавить миграцию в проект с новым форматом, вы увидите, что в файле csproj ничего не меняется.