Перетащите исходную папку в область «Группы и файлы» проекта, скажем, в группе «Ресурсы». В диалоговом окне выберите «Создать ссылки на папки для любых добавленных папок». Это создаст синюю папку, и папка и ее иерархия появятся в ресурсах приложений. Это автоматически создаст запись в фазе сборки «Копировать ресурсы комплекта». Обычно это делается для файлов справки.