В storage.mode (from) <- "double": NA введены путем принуждения - PullRequest
Новая
       31

В storage.mode (from) <- "double": NA введены путем принуждения

0 голосов
/ 15 июня 2019

Я использую Seurat и пытаюсь проанализировать набор данных, установленный из GEO. Но я получаю следующую ошибку.

Я пробую график tSNE с использованием R и Seurat, но я получил сообщение об ошибке CreateSeuratObject. 

> library(dplyr)
> library(Seurat)
> library(ggplot2)
> cancer.rna <- read.csv2(file = "/Users/desktop/GSE84133/GSM2230757_human1_umifm_countsnew3.csv", sep = ",",header = TRUE, row.names = NULL)
> dim(cancer.rna)
[1] 16381  1651
> cancer.rna[1:5, 1:5]
       X TGCCTCAC.TGGGATTC AGAGACTA.GATTGCGA GAGGGAGGTA.GAAGGCTT GAGAGAGTAT.CCTATTCA
1   A1BG                 0                 0                   0                   0
2   A1CF                 0                 0                   0                   2
3    A2M                 4                 0                   0                   0
4  A2ML1                 0                 0                   0                   0
5 A4GALT                 0                 0                   0                   0
> cancer <- CreateSeuratObject(counts = cancer.rna, project = "GSE84133", min.cells = 3,  min.features = 200) 
Warning message:
In storage.mode(from) <- "double" : NAs introduced by coercion

У меня было сообщение об ошибке: В storage.mode (from) <- "double": NA введены по принуждению. Подскажите пожалуйста как это работает. </p>

...