Я столкнулся с таким несовместимым поведением с UITableViewController при использовании Save Area и iPhone X
Я не использую контроллер навигации и в зависимости от того, начинаю ли я в портретном режиме, а затем поворачиваюсь в альбомную или начинаю в альбомной, а затем поворачиваюк портрету у меня такая ситуация как на фотках.