Итак, вы хотели иметь 2 цикла для ваших массивов, которые будут использоваться в вашем запросе. Вместо этого вы используете индексы в своем цикле.
// count of items. from what you wanted to do to your loop
// it looks like it is given that the count of 2 arrays are
// the same.
$count = count($aaa[$key]);
for ($i = 0; $i < $count; $i++) {
$qd = "INSERT INTO aaa (xxx, yyy, status) VALUES ($aaa[$key][$i], $bbb[$key][$i], '1')";
$dd = mysqli_query($conn, $qd);
if ($dd) {
echo '1';
} else {
echo mysqli_error($conn);
}
}