У меня есть геном около 2 ГБ, состоящий из эшафот
Я бы случайно выбрал геном.
Я использовал reformat.sh, но вывод был только скаффолдом. Мне нужно 1/3 всего генома ...
>LGKD01000001.1 Octopus bimaculoides isolate UCB-OBI-ISO-001 Scaffold4_contig_1, whole genome shotgun sequence
GAACAGCATGAATGTTAAAACtgaaatggatgatgatgatgatgatgatgatgatgatggcagcaacAGCCatgattatatttaatatgttgttagttataatcataataatgatgataatgttgataacaaTAATGGTTGCAATAATG
>KQ415657.1 Octopus bimaculoides isolate UCB-OBI-ISO-001 unplaced genomic scaffold Scaffold5, whole genome shotgun sequence
tatatatatatagtcaattcgagGATGTTAGATCGACAATGGGGATTATAGAATCCCACAAAAAATTCCACTGGT
>LGKD01000032.1 Octopus bimaculoides isolate UCB-OBI-ISO-001 Scaffold12_contig_1, whole genome shotgun sequence
GAAGTGGTAAAGAGTgcgatgcgctgaaaaaagagagaacagtacttgaaatGTGGTTTCATTCTagtagtaaat
>LGKD01000033.1 Octopus bimaculoides isolate UCB-OBI-ISO-001 Scaffold16_contig_1, whole genome shotgun sequence
ctgaTCAACAGAatagggccaatcattcttcatgacaatgctcgaccacacgttttaCTAATGA
>LGKD01000034.1 Octopus bimaculoides isolate UCB-OBI-ISO-001 Scaffold22_contig_1, whole genome shotgun sequence
TTATCTATATACGagaatattatctatatataaaggaataccaaaaaaacaagaacaacgggtcattcggaattttcttt
Есть сценарий, способный сделать это?