Да, независимо от того, как вы развертываете, вы можете развернуть один за другим.
Если вы развертываете, копируя свои WAR-файлы в standalone/deployments, тогда да, вы можете (1) запустить пустой сервер, а затем (2) скопировать войны один за другим вручную или с помощью сценария оболочки. Однако вполне возможно, что ваша проблема снова появится, когда вы выключите и снова запустите полностью развернутый сервер. Чтобы решить эту проблему, возможно, у вас может быть скрипт для отмены развертывания WAR-файлов перед выключением сервера.
Вы можете достичь аналогичного эффекта, используя jboss-cli: (1) запустить пустой сервер (2) подключить клиент Cli * jboss-cli.sh --connect и (3) развернуть один за другим WAR-ы: deploy ~/Desktop/my-app1.war .. См. https://docs.wildfly.org/16/Admin_Guide.html#standalone-server-3