Совет 1 :
При использовании varialbes и шаблонов ошибка без значений должна напоминать об использовании соответствия регулярному выражению (=~) вместо обычного оператора совпадения строк (=), поэтому замените:
disk_used_percent{job="$node",path="$fsmounts"}
с
disk_used_percent{job="$node",path=~"$fsmounts"}
(В этом случае Графана передает запрос типа path="/home|/|/boot" Прометею).
При этом фактически получается (несколько) серий (ов), вместо ошибки пропуска ведущий «нет значений».
Совет 2:
Что касается вашей реальной проблемы (несколько графиков внутри одной панели, вместо повторения графика), я иногда замечаю, что Grafana не всегда включает повторные панели, как только он настроен (я не знаю, если ошибка включена моя сторона или Grafana v5.x!).
Так что я советую попробовать либо:
* перезагрузить график (изменить значение переменной в раскрывающемся меню или сложить + развернуть родительскую строку.
* перезагрузите приборную панель (сохраните приборную панель, затем фактически перезагрузите страницу [нажмите F5]).
Надеюсь, это поможет