Что касается скорости IDE, обновление до VS2008 сделало для меня заметное улучшение. Конечно, лучшее оборудование (особенно больше памяти) также поможет.
Но я сомневаюсь, что вы когда-нибудь получите ту же производительность, что и VS6 - это была намного меньшая среда (с точки зрения использования памяти) и была полностью нативным кодом.
Что касается скорости того, что вы создаете - если вы сравниваете яблоки с яблоками (сборка релизов собственного кода и сопоставимые функциональные возможности), то, что вы создаете с помощью VS2005, не должно быть медленнее, чем то, что вы строите с помощью VS6.