Можно использовать одну и ту же папку bin для разных веб-приложений (.net 4.6) в службе приложений Azure (возможно также и в IIS)
Я хотел бы иметь в папке bin, и для каждого веб-приложения есть различные web.config, как показано ниже
root
|
| BIN (share *.dll)
|
|- App1
|-- web.config
|
|- App2
|-- web.config
|
|- App3
|-- web.config
Спасибо!