пожалуйста, вы можете показать образец ваших данных?
В любом случае, я думаю, вам нужно следующее:
df_common<-data.frame(df[which(df$genes %in% df$interactors),])
это проверка, какие элементы в столбце "гены "во фрейме данных df также присутствуют% в% столбца" интеракторы "в том же фрейме данных
Это то, что вы ищете?если нет, пожалуйста, вставьте ввод и желаемый вывод