Вы можете сделать это как левое соединение, где результат соединения равен нулю:
SELECT CSP69.fcpopkey,
CSP69.fcpoptext,
CSP69.fcpopval,
CSP69.fnorder,
CSP69.fcpopacces
FROM M2MData69..CSPOPUP CSP69
LEFT JOIN m2mdata01..cspopup CS01 on SC01.indentity_column = CSP69.identity_column
WHERE CSP69.fcpopkey = 'SHIPVIA'
AND CS01.identity_column is null
Хотя, по моему опыту, производительность будет влиять на конечный результат больше, чем на изящность кода. Вы также можете сделать не в:
SELECT CSP69.fcpopkey,
CSP69.fcpoptext,
CSP69.fcpopval,
CSP69.fnorder,
CSP69.fcpopacces
FROM M2MData69..CSPOPUP CSP69
WHERE CSP69.fcpopkey = 'SHIPVIA'
AND CP69.identity_column not in
(select identity_column from m2mdata01..cspopup)