Мне удалось выяснить проблему. Это было двунаправленное отображение «один ко многим» между обслуживанием и уточнением.
Классификация Servico
/**
* @OneToMany(targetEntity="Precificacao", mappedBy="servico", cascade={"persist"})
* @var Collection
*/
private $precificacoes;
Отображение класса Precificacao
/**
* @ManyToOne(targetEntity="Servico", inversedBy="precificacoes", cascade={"persist"})
* @JoinColumn(name="servicoId", referencedColumnName="id")
* @var Servico
*/
private $precificacoes;
Затем я исправил запрос
public function getByUnidadeAnoSemestre(int $unidadeId, int $ano, int $semestre) : array
{
$query = $this->em->createQuery(
'SELECT s,u,p FROM ' .
Servico::class . ' s ' .
'INNER JOIN ' .
's.unidade u ' .
'INNER JOIN ' .
's.precificacoes p ' .
'WHERE ' .
'u.id = :unidadeId ' .
'AND p.anoLetivo = :ano ' .
'AND p.semestre = :semestre'
)->setParameters([
"unidadeId" => $unidadeId,
"ano" => $ano,
"semestre" => $semestre
]);
return $query->getResult();
}