Очень полезным для таких операций является инструмент импорта Matlab, который вы найдете на вкладке «Главная» и используйте для создания функции импорта (Matlab-Code).
Этот инструмент позволяет вам выбирать графически необходимые данные и объявлять формат данных и имена переменных. Вместо того, чтобы импортировать эти данные напрямую, вы можете сгенерировать функцию импорта. Эту функцию вы можете использовать для импорта всех 100 .csv файлов в цикле. Далее вы можете чередовать код для более подробных настроек импорта.
(подробное объяснение: https://www.mathworks.com/help/matlab/ref/importtool-app.html)
Надеюсь, это поможет, ура